Initial

01 octombrie 2008 - 10 decembrie 2008
Etapa I : Documentare si constituire a colectiei de prelevate biologice; caracterizarea fenotipica si genotipica a colectiei bacteriene

  • I.1 - Stabilirea criteriilor clinico-epidemiologice de selectie a pacientilor si elaborarea formularului de insotire a produselor patologice CO
  • I.2 - Documentare privind diagnosticului molecular in bacteriologie si factorii de virulenta ai Enterobacteriaceelor P1
  • I.3 - Documentarea privind rolul diagnosticului molecular in bacteriologie si particularitati in infectiile enterale P2
  • I.4 - Elaborarea protocolului de lucru privind detectarea rezistentei la antibiotice prin metode fenotipice; Documentare stiintifica privind genetica rezistentei la antibiotice;
    • - Construirea primerilor si elaborarea protocolalelor de lucru pentru detectarea moleculara a genelor responsabile de rezistenta la antibiotice beta-lactamice;
    • - Elaborarea protocoalelor de lucru pentru detectarea moleculara a patotipurilor intestinale de E. coli P3
  • I.5 - Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae (identificarea microbiologica primara, determinarea caracterelor metabolice (biotip), a factorilor de virulenta bacteriana in tulpinile de Enterobactericeae din izolatele clinice) P1
  • I.6 - Definirea protocolului si introducerea metodelor de diagnostic molecular in bacteriologie (genotip); cursuri de instruire privind diagnosticul molecular in bacteriologie P2
  • I.7 - Determinarea caracterelor antigenice (serotip) pentru tulpinile de Salmonella spp, Shigella spp, E. coli si Yersinia spp
    • - Determinarea profilului de sensibilitate la bacteriofagi (lizotip) pentru tulpinile de Salmonella spp. P3

11 decembrie 2008 - 30 mai 2009
Etapa II : Evaluarea fenotipului de sensibilitate la antibiotice a tulpinilor colectiei de studiu

  • II.1 - Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae; Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica); cursuri de instruire privind diagnosticul molecular in bacteriologie P1
  • II.2 - Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae P2
  • II.3 - Determinarea CMI pentru tulpinile rezistente la antibioticele (betalactamine, fluoroquinolone); testarea producerii de betalactamaze cu spectru extins (BLSE) prin metoda "dublului disc" P3
  • II.4 - Identificarea moleculara prin PCR a genelor codante pentru factori de virulenta specifici diverselor patotipuri de E. Coli P3

01 iunie 2009 - 10 decembrie 2009
Etapa III : Identificarea la tulpinile colectiei a genelor codante pentru betalactamaze din clasele moleculare Ambler A, B, C si D

  • III.1 - Conceperea paginii web a proiectului, biblioteca virtuala, abonament revista specialitate , Audit intern (etapele I, II, III si IV) CO
  • III.2 - Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae. Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica); cursuri de perfectionare privind diagnosticul molecular in bacteriologie P1
  • III.3 - Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae P2
  • III.4 - Identificarea claselor de betalactamaze prin izoelectrofocusare;
    • - Detectarea moleculara prin PCR a genelor bla; secventierea produsilor de amplificare in vederea identificarii alelelor codante pentru betalactamaze;
    • - Comunicarea rezultatelor in sesiunea stiintifica a Societatii Romane de Microbiologie;
    • - Prezentarea rezultatelor la Congresul Balkanica 2009 P3

11 decembrie 2009 - 30 mai 2010
Etapa IV : Detectarea bazei moleculare a rezistentei la fluoroquinolone la tulpinile colectiei

  • IV. 1 - Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae; Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica) P1
  • IV.2 Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae; participare la manifestari stiintifice interne si externe, publicare de rezultate finale P2
  • IV.3 - Analiza prin PCR-secventiere a regiunii care determina rezistenta la quinolone (quinolone resistance-determining region /QRDR) a genei gyrA
    • - Detectarea prin PCR a genelor plasmidice qnrA, qnrB si qnrS implicate in rezistenta la fluoroquinolone
    • - Prezentarea rezultatelor stiintifice la Sesiunea Anuala a Societatii Romane de Microbiologie
    • - Publicare rezultatelor intr-o revista indexata Medline P3

01 iunie 2010 - 10 decembrie 2010
Etapa V : Analiza clonalitatii intraspecifice a izolatelor clinice de Enterobacteriaceae rezistente la antibiotice

  • V.1 - Audit intern (etapale V si VI); conceperea unui ghid de antibiotico-terapie pentru institutiile sanitare, up-datare pagina web; organizare 2 workshop-uri (studenti/rezidenti/specialisti BI) CO
  • V.2 - Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae; Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica); participare la manifestari stiintifice interne si externe, publicare de rezultate finale P1
  • IV.3 - Determinarea profilului de macrorestrictie a ADN genomic prin electroforeza in camp pulsator ( PFGE); evaluarea heterogenitatii diverselor populatii de Enterobacteriaceae rezistente la antibiotice izolate din infectiile umane; publicarea rezultatelor intr-o revista cel putin indexata Medline P3

Act aditional 2009 :

1. Schimbare deadline pentru et I si II : Etapa I 01 octombrie 2008 - 30 ianuarie 2009; Etapa II 01 februarie 2009 - 10 decembrie 2009.

2. Deplasarea unor activitati si rezultate specifice din etapa II in celelalte etape (III si IV). Activitatile etapei II :

  • II.1 Conceperea paginii web a proiectului; Audit intern (etape I, II) CO
  • II.2 Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae. Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica) P1
  • II.3 Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae P2
  • II.4 Detectarea moleculara prin PCR a genelor bla; secventierea produsilor de amplificare in vederea identificarii alelelor codante pentru betalactamaze; comunicarea rezultatelor in sesiunea stiintifica a Societatii Romane de Microbiologie P3.

3. Comasarea etapelor IV si V initiale intr-o singura etapa IV : Etapa III 11 decembrie 2009 - 30 mai 2010; Etapa IV 01 iunie 2010 - 10 decembrie 2010.

Act aditional 2010 :

1. Etapele I si II au fost efectuate in 2009, ramanand neschimbate.

2. Schimbare deadline pentru etapa III : 11 decembrie 2009 - 10 decembrie 2010 si etapa IV : 11 decembrie 2010 - 10 septembrie 2011.

3. Activitatile etapei III :

  • III.1 Mentinerea paginii web a proiectului, biblioteca virtuala, abonament revista specialitate; audit intern etapa 3, CO
  • III.2 Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae; screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica), cursuri de perfectionare privind diagnosticul molecular in bacteriologie P1
  • III.3 Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae P2
  • III.4 Identificarea moleculara prin PCR a genelor codante pentru factori de virulenta specifici diverselor patotipuri de E. Coli P3; determinarea CMI pentru tulpinile rezistente la antibioticele (betalactamine, fluoroquinolone); testarea producerii de betalactamaze cu spectru extins (BLSE) prin metoda "dublului disc" P3.

Act aditional 2011 :

1. Etapele I si II au fost efectuate in 2009 iar etapa III in 2010, ramanand neschimbate.

2. Activitatile etapa IV :

  • IV.1 Audit intern etapa 4, aducere la zi pagina web; organizare 2 workshop-uri; prelucrare statistica rezultate CO
  • IV.2 Constituirea colectiei de tulpini de Enterobactericeae; Screening-ul sensibilitatii la antibiotice (antibiograma difuzimetrica); participare la manifestari stiintifice interne si externe, publicare de rezultate finale; cursuri de perfecționare privind diagnosticul molecular in bacteriologie P1
  • IV.3 Perfectarea metodelor de diagnostic molecular pentru Enterobacteriaceae; participare la manifestari stiintifice interne si externe, publicare de rezultate finale P2
  • IV.4 Analiza prin PCR-secventiere a regiunii care determina rezistenta la quinolone a genei gyrA; detectarea prin PCR a genelor plasmidice qnrA, qnrB si qnrS implicate in rezistenta la fluoroquinolone; determinarea profilului de macrorestrictie a ADN genomic prin electroforeza in camp pulsator (PFGE); evaluarea heterogenitatii diverselor populatii de Enterobacteriaceae rezistente la antibiotice izolate din infectiile umane; prezentarea rezultatelor stiintifice la Sesiunea Anuala a Societatii Romane de Microbiologie; publicare rezultatelor intr-o revista indexata Medline.